Ad arricchire il già prestigioso fondo musicale di famiglia, la Biblioteca Gianni Milner ha acquisito negli anni per donazione, lascito o acquisto, numerosi fondi librari, fra i quali si segnalano: il fondo Guido Bianchini (musica manoscritta e a stampa), la donazione dei libretti d’opera di Angelo Sullam e Gino, i fondi Giorgio Magrini e Giovanni Baldi Zenoni(musica da camera fine Ottocento inizio Novecento), Alfredo Ceccherini (musica per banda),le raccolte di Elio Borsetto (oltre duemila e duecento incisioni in vinile di musica jazz) e Pier Vittor Grimani (collezione di dischi in vinile , molti dei quali a 78 giri), fondo Gaberlotto (partiture di musica a stampa dei più noti musicisti contemporanei: Bussotti, Mosca, Castiglioni, Nono, Sciarrino, ecc.), il Fondo CEMS (una raccolta della produzione a stampa della casa editrice che fu tra le realtà editoriali che maggiormente si impegnarono nella pubblicazione di un repertorio musicale secondo i dettami del Motu Proprio di San Pio X), i fondi dei compositori, Samuele Levi, Ausonio De Lorenzi Fabris (musica manoscritta e a stampa, bozzetti, lastre di zinco), dei cantanti lirici Gianni Guidetti (una raccolta di programmi di sala di teatri italiani ed europei) e Ginevra Vivante, dei musicisti Virginia Bronzini (musica per pianoforte), Luca De Marchi (un piccolo lascito, si compone di alcuni manoscritti di cui 5 composizioni riferite al compositore Guglielmo Bussoli) e Ruggero Gerlin (minute di corrispondenza familiare), il fondo Safred (studi sugli strumenti ad arco), del critico Guido Piamonte e del musicologo Giuseppe Massera (critica musicale, musicologia e storia della teoria musicale), del direttore d’orchestra e compositore Giovanni Losavio (musica manoscritta e a stampa) e del direttore d’orchestra Roberto Cecconi, il fondo dell’etnomusicologo Roberto Starec, il fondo del compositore per musica da film Giovanni Fusco  e i fondi dei massimi esponenti di critica e storia in cinematografia musicale italiana Sergio Miceli, Ennio Simeon, Sergio Bassetti.
L’acquisizione di fondi è continua e in via di aggiornamento.